Araştırmacılar çölyak hastalığı olan kadınların çoğuna tanı konulabildiğini belirtmektedir. Tanı ve teşhis için öncelikle doktor tarafından ayrıntılı öykü alınır ve fiziki muayene yapılır. Bunlar dışında doktorlar hastalardan farklı testler de isteyebilir. Seroloji testi bunlardan birisidir. Bu testte kanda bulunan antikorlar araştırılmaktadır. HLA-DQ2 ve HLA-DQ8 isimli genetik testler de çölyak hastalığının teşhisi için kullanılmaktadır.



Teste sonucunda Çölyak hastalığı destekleniyor ise doktorlar hastaların ince bağırsaklarını endoskop adı verilen ve ucunda kamera bulunan bir kanül yardımı ile incelemektedir. İşlem esnasında gerek duyulur ise biyopsi de alınabilir.